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label-free定量蛋白质组
2016-11-08 09:07:13
特点:定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理功能,同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。
MORE质谱多反应监测PRM(Parallel Reaction Monitorin)定量技术
2016-11-08 09:07:55
特点:质谱多反应监测PRM(Parallel Reaction Monitorin)定量技术是通过选择目标蛋白质的定量代表性肽段,让质谱仅对这些肽段进行质谱信号采集,从而获取目标蛋白质定量信息的质谱技术。利用该技术既可实现样品中靶标物质的相对定量,又可通过合成同位素标准肽段,绘制标准曲线,实现蛋白质的绝对定量。
MORE标记定量蛋白质组(iTRAQ和TMT)
2016-11-08 09:08:40
特点:iTRAQ和TMT是目前运用最广泛的两种标记定量蛋白质组技术,分别通过与氨基酸末端氨基以及赖氨酸残基的游离氨基结合,实现对多肽的标记,并通过不同分子量的试剂对不同来源样品进行标记的方式实现不同样品间蛋白质组比较的目标。以iTRAQ试剂为例,该试剂结构由指示基团、中性平衡基团和反应基团三部分组成。不同指示基团及其相对应平衡基团的质量和都相同,而反应基团能与赖氨酸ε氨基和所有肽链的氨基末端连接,可标记所有氨基酸。不同标记试剂与来源于不同样品胰酶消化后的肽段结合,经过色谱分离,并通过一级质谱和二级质谱。平衡基团在二级质谱时发生中性丢失,而报告基团在二级质谱低质量区域产生多个报告离子,其信号强度分别代表该标记样品的表达量,根据报告离子的峰面积计算同一蛋白质同一肽段在不同样品间的比值,从而实现蛋白的相对和绝对定量
MORE蛋白课题研究
2016-11-08 09:09:15
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